前總統馬英九被控洩密等案，台北地院一審判馬無罪，檢方不服提出上訴，高等法院二審30日開庭，馬英九重申無罪，全案辯論終結，訂5月15日上午10時宣判，對此，民進黨立法院黨團總召柯建銘表示，絕不容許藉口「統治行為」，藉由違法監聽，進行「特務治國」，藉由檢察機關、恐龍法官不當操做與介入，毀憲亂政，司法應重新贏回人民的信任。
「如果違法的威權統治行為，可以成為憲政慣例，台灣將很難成為一個偉大的民主憲政國家！」柯建銘30日晚間發布新聞稿表示，總統當然有權與行政院長討論國家大政方針，但絕非「密室」召集行政院長、最高檢察總長，針對司法個案進行政治操作、違法監聽、特務治國，這樣的毀憲亂政行為，不可稱為「統治行為」，更不能成為「憲政慣例」，只能以違法威權統治行為加以形容。
柯建銘指出，絕不容許總統藉口「統治行為」，卻藉由違法監聽，進行「特務治國」，藉由檢察機關、恐龍法官不當操做與介入，毀憲亂政，希望透過「馬英九洩密案」的審理，為憲政體制除垢，展現新的民主價值，讓司法重新贏回人民的信任，使恐龍法官絕跡，將是台灣司法史上的一個重要分水嶺。
針對馬英九的無罪抗辯，柯建銘批評其為狡辯之詞，特偵組進行「行政不法 」調查？在法院組織法中，特偵組職權，涵「一、涉及總統、副總統、五院院長、部會首長或上將階級軍職人員之貪瀆案件：二、選務機關、政黨或候選人於總統、副總統或立法委員選舉時，涉嫌全國性舞弊事件或妨害選舉之案件：三、特殊重大貪瀆、經濟犯罪、危害社會秩序，經最高法院檢察署檢察總長指定之案件」，內容均本是刑事案件偵察，完全不針對「行政不法」進行調查。
特偵組存有「後續偵察作為」文件，使前檢察總長黃世銘調查「行政不法」證詞不被接受，而被定罪。
柯建銘進一步表示，馬抗辯擔心引發政治風暴、憲政風暴，而以「最大限縮、最小侵害」處理該案，但實際上卻是顛倒黑白，「以最小限縮、最大侵害」掀起憲政風暴與政治風暴，其手法類似當年國民黨處理美麗島事件，「未暴先鎮，以鎮引暴」，民進黨才對當時行政院長江宜樺提出不信任案，然而，當時民進黨為少數政黨，提案只是「政治表態」，根本未能通過不信任案，也無法引起政治風暴。
柯建銘指出，「馬英九洩密案」從2013年起至今年為止，已歷經4年半時間，馬英九是否涉及毀憲亂政、操作司法，每人心中都有一把尺，不是透過狡辯就可以諉過，本案將是台灣司法史上最重要的一個分水嶺，其重要性不亞於憲法法庭，必須透過本案的審理終結特務治國與捍衛憲政體制，對於馬英九的撕裂憲法、毀憲亂政行為必須有所制裁，以落實促進轉型正義的目標，讓司法真正獨立、民主價值獲得展現。
總統職權憲法有明文規定，柯建銘說，不應公然介入司法個案的操作，馬英九將職權無限擴大，根本是毀憲亂政行為，尤其其「五權合一」：總統、黨主席、行政院長、立法院長、政策會執行長，將國民黨政權導入衰退之路，是政治上可以見證的一頁歷史。
對於馬英九援引司法院大法官會議解釋第585、627號解釋，柯建銘建議他應該好好拜讀，因為這兩個解釋，585號是指行政機關有「保密特權」、627號解釋則是指總統擁有國家機密特權，但均非指其有「洩密」特權。
柯建銘強調，憲法第44條雖規定「總統對於院與院間之爭執，除本憲法有規定者外，得召集有關各院院長會商解決之」，然而，台灣自從實施憲政以來，卻從未實施，即使在318太陽花學運期間，馬英九要求立法院長王金平動用警察權，但王金平也未到總統府商議，連陳水扁前總統面對有關核四停建議題召見王金平，王金平也未參與，故本案根本非院際爭議，馬英九肆意擴充違憲解釋，令人質疑其法學水準。
