蔡英文一當選總統，綠營地方首長紛紛出現盼中央部會暨國營企業南遷的聲音，所持理由是為了「平衡南北差距，促進中南部經濟發展」。此舉立即引來不少批評聲浪，包括浪費國家資源、開錯藥方、政治算計等。其實這樣的主張在阿扁主政後期曾經出現過，當時還大張旗鼓要求各部會準備南遷；後因阻礙重重，最後只有漁業署和體育署從台北搬到高雄，成為扁政府部會南遷的樣板。為安撫被迫南調的漁業署百餘員工，在沒有法源的情況下，還破例發給每人每月2萬元的南遷津貼。
當初將漁業署南遷，所持理由為可貼近漁民心聲、合乎產業需求、可提升行政效率、能照顧中南部地區，平衡南、北區域發展等。儘管學者專家批評是錯誤政策，沒有實質效益，還是抵擋不住政治考量。事後證明，部會間開會協調還是要北上；該署高層在台北辦公的時間，遠遠超過坐鎮高雄總署聽取漁民心聲的時間；加以人心浮動，自然影響到服務效能與品質，引發漁業界反彈，反而造成更多行政資源的浪費。
因此馬英九執政後，又陸續把原先南遷的部門與人員分批遷回台北辦公，目前大多數員工與設施已經搬進台北新大樓。唯為了選舉考量，避免南部民代反彈，對外仍宣稱總署還在高雄，並沒有搬回台北，造成民眾洽公與文書往來上的困擾，也坐實了外界對漁業署搬遷攸關政治而非專業考量的質疑。漁業署究竟該歸屬何處？應該以漁業發展為主要考量，不應成為政治籌碼。
馬政府如果認為當初扁政府硬將漁業署南遷造成經費浪費、專業人才流失、服務品質降低、機關間工作聯繫協調不易，是為騙取南部選票，是項魯莽錯誤的決策，就應該向國人公開說明，再大大方方將漁業署遷回台北。那麼未來無論誰執政，除非有具說服力的理由，都不應重演這種勞民傷財的無聊戲碼。遺憾的是，馬總統執政八年，便宜行事，採偷偷摸摸方式，也不對外說明。
如今換人換黨執政，部會南遷聲音又起，漁業署恐再度陷入大舉搬回高雄前鎮的窘境，讓人為漁民、漁業署員工及家屬叫屈。漁業當務之急，在於盡速解除因遠洋漁業管理鬆散遭歐盟舉黃牌警告恐影響水產品輸歐、損及國際形象的重大事件。前事不忘後事之師，民進黨地方首長在主張部會南遷時，應深入瞭解漁業署南遷案例，才不會重蹈覆轍。
台灣南北區域發展失衡是事實，關鍵在於過去重大經濟建設的重北輕南。因此未來應著重發展因地制宜的產業政策，提高南部就業機會，進而帶動附近房地產及周邊服務業的發展，而不是勞師動眾的遷移，惹來更多民怨。目前設置的南部辦公室既無經費也無實權；且人選多為政治考量，無法發揮應有功能，應優先予以檢討改進。
蔡英文總統背負689萬人的期待，又要面對千瘡百孔的國政，應先穩住國家機器，展現治國能力，別急著拋出有爭議的議題，反而虛耗時間與精力。只要中央主政者能揚棄過去「從台北看天下」的首都圈思維，相信中南部發展指日可待。
