豪雨來襲造成全台農作災損嚴重，總統蔡英文今4日（日）上午先後視察雲林、嘉縣災損情況與復原工作，蔡英文總統在雲林表示，全國納入天然災害現金救助範圍。農委會隨後於下午已公告新北市、臺中市、彰化縣、南投縣、雲林縣及嘉義縣等為農業天然災害救助之現金救助及低利貸款地區，由於「0601豪雨」仍影響臺灣地區，各地方政府亦持續辦理農業災損統計中，農委會將依地方政府報請農業災損情形公告辦理農業天然災害救助。
雲林縣長李進勇並向蔡總統建言，農業災損現金救助「從寬從速」，請農委會協助修改相關法規訂定辦法，以利基層公所人員勘查時有所依循，避免爭議造成官民對立，協助農民早日復耕。
此外，李進勇認為，地方治水，悠關民生，保障國民性命、財產安全，其重要性不亞於其他國家建設，他向總統建言應納入前瞻建設計畫中，把握治理良機，並對財政困難之縣市，給予必要之支持與協助。
嘉義縣長張花冠陪同總統蔡英文視察大林陳井寮時，強調此次雨量24小時內達300多毫米，讓北港溪、三疊溪及石龜溪水位倒灌，內水無法順利排出，讓鄰近的大林、溪口、梅山一帶淹水，相關工程及經費需中央協助。
總統蔡英文今6月4日（日）先前往雲林視察石牛溪善功橋洪水溢淹，隨後轉往大湖口溪自治橋上下游並勘查水稻災損情形；並前往嘉義縣視察「陳井寮排水系統」，雲林縣長李進勇與嘉義縣長張花冠分別陪同蔡總統視察勘災。
李進勇縣長舉北港滯洪池案，縣府規畫在40公頃台糖用地興設，解決北港溪中下游氾濫成災窘境，總經費約17億元，光土地取得成本就高達12億元，希望中央補助，另縣管河川清淤疏浚每年需要約1.3億元，對縣庫是很沈重的負擔，也請中央能協助。
總統蔡英文上午上午10點10分先前往雲林視察石牛溪善功橋洪水溢淹，隨後轉往大湖口溪自治橋上下游並勘查水稻災損情形。（圖/雲林林縣政府官網）
水利署長賴建信在斗南信義育幼院簡報石牛溪善功橋及大湖口溪自治橋上下游洪水溢淹情形，賴建信表示，因瞬間強降雨且河道蜿蜒，而河道中仍有私人土地，增加治水的難度，石牛溪目前尚有7公里、大湖口溪10餘公里河段未完成整治。
立委劉建國則表示，此次斗南地區淹水主因河川治理的經費、方法、執行力沒有到位，對於水利署指出善功橋上下游有私人土地，無法清淤，但下游的泥沙未清就有點說不過去；除了整治、清淤工作也非常重要，不要只有颱風來時才要清，石牛溪、大湖口的整治工程，希望經費可以一次到位，不要分段，發揮總合治水效用。
蔡英文聽取簡報後表示，氣候急遽變遷，天災的危害更嚴重、速度更快，治水工程納在前瞻計畫裡，持續性、系統性的整合治水，加速執行高度整合發揮效用，經費整體規畫，不足經費則由前瞻計畫補足，對財政困難縣市也應特別予以協助，不能把一套公式，僵硬套在所有縣市上。
蔡總統視察大林陳井寮 張花冠親以簡報說明治水需求，張花冠指出，中央政府6年600億綜合治理計畫很有成效，淹水次數、面積也都漸漸在減少，嘉義縣有相當多河川水系，包含八掌溪、朴子溪、北港溪等等，由於目前北港溪沿線支流排水系統還沒完全進行改善，遇到颱風豪雨時會造成鄰近地區淹水狀況，以本次0601豪雨為例，若能針對陳井寮滯洪池、早知排水、埤子頭排水系統中的主要排水系統及支流系統等進行全面性改善，就能有效解決淹水問題。
張花冠說，地方政府財政相當困難，一年水利治水計畫經費只有3,500萬，而水環境建設計畫治理工程縣府需自籌一成款，就此次工程改善經費需求9.15億元為例，嘉義縣就需另外自籌約一億元配合款，等同縣府3年之治水預算，縣府實在難以負擔，希望中央政府能比照「易淹水治理計畫」、「流域綜合治理計畫」治理工程皆能全額補助，用地則補助7成。
經濟部次長楊偉甫回應，過去治水計畫運用非工程的措施建造許多滯洪池，在這次豪雨中發揮很大的效應，但仍有部份地區如今日看到的陳井寮仍有增設的必要，過去土地徵收上因滯洪池需使用大面積土地而需花費不少經費，目前希望與地主合作，讓地主保留土地所有權來建置滯洪池，希望能用這種方式來解決地方政府徵收土地付出的成本與財政壓力。
