針對昨（8）日大法官釋憲做出第745號解釋認定，所得稅法中有關薪資所得扣除額以設限方式身被違憲，財政部今（9）日做出正式回應，同意針對大法官認定違憲部分進行檢討，於兩年內修正所得稅法薪資扣除額認定方式。財政部認為，現行採用定額扣除額方式也具有「降低稽徵成本」的正當性，對於大法官解釋，未來將會尋求合理計算方式。據了解，未來很有可能採行兩種方式採認的雙軌模式，但稽徵技術仍待研究，500多萬戶薪資所得申報戶可望2019年報稅便可適用。
我國所得稅法針對勞工、軍公教、警察等受薪階級民眾，在申報所得稅時，均採收入總額減掉免稅額、特別扣除額等細項後，以不同稅率計算所得稅，目前每人每年薪資扣除額為12.8萬元，而醫師、律師等職業的收入則視為執行業務所得，才可以把執行業務成本按實報實銷方式扣除。
但在薪資所得採定額扣除的這項作法，昨日遭大法官會議解釋認定「設定上限」違憲，大法官認為，受薪階級的薪資所得若須付出「必要費用」，且此費用加起來超過12萬8千元，按照「租稅公平」原則，只要民眾能列舉出必要支出，都應比照「執行業務所得」減除後申報，因此要求財政部必須在兩年內檢討。
由於目前綜合所得稅總稅額當中，薪資所得來源稅收佔近半數，薪資所的申報戶數高達540萬戶，也是所得稅最重要的稅基來源，因此這項釋憲勢必對所得稅收造成影響。
財政部今日由賦稅署副署長宋秀玲出面做出正式回應，宋秀玲強調，目前各主要國家為考量便民以及量能課稅原則，所得稅扣除必要費用方式有核實、定額、定率等方法，因應大法官做出解釋，將再收集各國作法，於範圍內依照大法官解釋，檢討修正所得稅法。
但財政部也強調，雖然大法官認為薪資所得採設定定額上限方式違反租稅公平原則，不過現行方式的採用，也是適度減輕薪資所得者的稅負，也兼顧量能課稅及稽徵簡便的原則，有降低稅捐稽徵成本的正當性存在。財政部認為，以2015年度綜合所得稅總申報戶共613萬戶來看，申報薪資所得戶數約540萬戶，據估計薪資所得者適用稅額試算服務比例高達9成以上，該服務對薪資所得者確有簡化申報及大幅節省成本與時間效益，維持該服務及持續提升其服務品質益顯重要。
宋秀玲表示，大法官也未認定現行定額扣除是不對的，只是認為與其他類別所得申報的計算有差別待遇。因此未來會再收集資料進行調整。據了解，財政部不排除會採取與執行業務所得申報時採行核實制的方式，讓定額以及核實雙軌並行，不過相關認定技術還需要進一步研究。
由於大法官解釋必須於2年內完成檢討，宋秀玲表示，財政部會加緊進行修法工程，最快年底前收到初步資料，針對各行業成本費用做研究，希望能在2019年完成修法，2020年申報2019年所得時即可適用。
