總統蔡英文今（1）日在新年談話中針對兩岸關係，提及「如果連疫情防治都不能真心合作，哪來的兩岸一家親」，對此，台北市長柯文哲出席元旦健走活動時表示，像九二共識、兩岸一家親，在台灣就被標籤化，「最重要還是彼此有善意比較重要，大家都心裡面有芥蒂，你再講什麼也沒有用」。
總統府上午舉行升旗典禮，除了總統蔡英文、副總統陳建仁夫婦之外，台北市長柯文哲也獲邀出席，不過現場蔡英文與柯文哲中間相隔兩個位置，兩人並無互動，另外包括行政院長賴清德、行政院秘書長陳菊也一同出席升旗。
不過蔡英文在新年談話中表示，不反對兩岸正常互動及城市交流，「不過兩岸之間的交流要健康、要正常，不能靠模糊的政治前提，或者強迫就範的通關密語」，同時也說，「如果連疫情防治都不能真心合作，哪來的兩岸一家親？」似乎是在針對柯文哲在台北上海雙城論壇所提及的「兩岸一家親」。
對於蔡英文的談話，柯文哲上午接受媒體訪問時表示，「這沒什麼矛盾啊，還好啊，如果是對中國喊話那就喊話」。
記者也追問，他怎麼看總統特別提到兩岸一家親，柯文哲表示，「我已經講過，像九二共識、兩岸一家親，在台灣就被標籤化，每次都要拿出來講一講。唉呦，我看是這樣啦，其實最重要還是彼此有善意比較重要，大家都心裡面有芥蒂，你再講什麼也沒有用」。
至於是否認為蔡總統是針對他，柯文哲則說「不會啦」，在總統府前元旦升旗，其實他跟蔡總統沒辦法互動，因為大家進去會場就要排隊照相，照完相就整隊出來了，根本就是照流程在走，沒有機會互動。
另外，媒體也問到美國智庫戰略暨國際研究中心（CSIS）專家葛來儀（Bonnie Glaser）否認柯文哲在與她見面後就敲定3月訪美行程，並批評柯幕僚扭曲事實，影射她和CSIS支持柯文哲競選總統。
柯文哲對此特別澄清，市府沒有在哪個地方說她來邀請，他沒有講，他的幕僚也沒有講，「這就是典型的假新聞」，先做個消息說葛來儀邀請台北市政府，然後再問葛來儀說市府說是她邀請，然後再來回應，「奇怪這不是典型的假新聞嗎？市府什麼時候講過？他只說市府在3月要去美國，就這樣」。
至於市府有接到葛來儀那邊邀請，柯文哲說，一般市府團隊去美國行程，因為美國在華盛頓跟紐約有很多智庫，所以去那邊有時候還是會去拜訪智庫，是市府要去拜訪人家，怎麼會是人家邀請我們，這實在差太多了。
