時代力量立委林昶佐近期在臉書連發兩篇千字文，第一篇文中提及，台北市長柯文哲雖說「兩岸一家親」，卻從未認同九二共識，不宜為他貼上紅統標籤。此話一出，林昶佐就遭批為拉選票而惜柯、棄守時力台獨黨綱。林昶佐今（23）日上廣播節目《蔻蔻早餐》時回應，他絕對反對兩岸一家親，並強調他沒有為選舉而要挺柯，「我可以不當立委，但我不能不當台獨運動者。」
節目上林昶佐解釋，這一、兩年來他為台獨運動的發展而緊張，面對年輕人紛紛倒向支持統獨立場模糊的柯文哲，他認為台獨運動者需要提出新的論述，吸引年輕人理解，不能再沿襲過去對待國民黨時所建構的辯論架構，包含批評柯文哲沒有臺灣價值、投共等。
林昶佐認為，現在台獨運動要進入新階段，「尤其現在年輕人都是天然獨，那我們要怎麼讓天然獨知道，我國跟中國的關係是對生活有影響的。」他指出，過去運動過程中提出建國、制憲、正名以及臺灣國家正常化等等，都是運動者一直再用新的論述、新的名字，吸引更廣泛的人支持，而現在他要做的事情也是同理。
至於面對柯文哲兩岸一家親的說法，他到底要不要批評，林昶佐重申，他反對兩岸一家親，但他也不要讓大家再進入意識型態的辯論，而是改由檢視柯文哲的市政績，看他每年1700億的經費，是不是有讓臺灣產業重新布局，慢慢脫離對中國的依賴關係。林昶佐稱，這才是務實的作法。
針對柯文哲昨拋出「認同卡」議題，要各節認同自己政治理念方可同框合照，林昶佐表示，即便認同卡內容不包含兩岸一家親，僅羅列市政議題，然而議員參選人未來在監督市長施政時，民眾只會看是否簽過認同卡，此事讓監督變得困難，「這對未來民主發展是有危險的。」
