香港主要學府之一的香港中文大學，9月4日上午舉行開學典禮；校園多處地點卻出現「香港獨立」的黑底白字中英文橫幅與海報；其中一部分在典禮開始前已被拆走。中大副校長沈祖堯（Sung Jao-yiu）表示，學校是個有言論自由地方，希望學生用和平理性態度表達意見，不要觸法（譯註：難道披掛橫幅、拉起布條，就涉及不和平、非理性？）
港媒《信報財經新聞》（Hong Kong Economic Journal reports）報導指出，一家名為「中大秘密」(CUHK Secrets)的臉書專頁，本週一刊登多張照片，網頁顯示中大校園多處地點，包括百萬大道的烽火臺、文化廣場等處，都出現「香港獨立」橫幅，以及印有「拒絕沉淪、唯有獨立」字樣海報。
目前無法得知究竟是何許人，將「獨立」字樣的中英文標語，在校園內到處懸掛張貼。
《信報》（ejinsight）英文版9月4日報導，引述中大學生會會長賈斯汀.歐（Justin Au）的看法指出，他個人認為獨立橫幅是中大學生自發性做為。
目前中大學生會活動中心，掛著一面橫幅，寫滿100多位「民主神祗」名字（the Goddess of Democracy statue，譯註：此一用詞，是為了表達對於香港年輕民主運動者的敬意），這100多人，為了爭取香港民主，如今卻成了遭受政治迫害對象。
香港中大學生會歐會長指出，就特殊意義而言，學生會辦公室內部掛起的香港政治犯名單，是為了紀念包括雨傘運動學生領袖黃之鋒、羅冠聰，以及周永康等人，他們分別判處6-8個月不等徒刑；2014年雨傘運動期間，他們在香港政府總部附近，揭開為期79天的和平佔領序幕。
2016年中國國慶67周年當天上午，包括港大、中大、科大、浸大、城大等15所大專院校的校園地標，幾乎同時出現紅底白字中英文字樣「香港獨立」橫幅。主張香港獨立的香港民族黨，承認設計和提供橫幅，但沒有派人進入院校散發，而是由學生自發性懸掛。
近幾年來，本土論述、港獨思潮，在大學院校及學界，迅速擴散開來：許多院校紛紛成立本土組織或關注組，支援本土運動與港獨。港媒《香港自由出版》（HKFP）引述香港中大2016年7月一項民調顯示，15-24歲在地年輕人，有近40%支持港獨，比例之高令人驚訝。
