台北地方法院檢察署今（31）日稍早宣佈，遠雄董事長趙藤雄涉嫌行賄，違反《證券交易法》、《商業會計法》等，綜合包含大巨蛋案在內的各個弊案起訴求刑。台北市長柯文哲上午受訪時大喊「這個就麻煩了」，如果趙藤雄短期內無法出獄，被繼續監禁下去，到底遠雄公司誰可以做決定？如果沒有人可以做決定，那這個案子（大巨蛋）怎麼繼續下去？
遠雄集團董事長趙藤雄因涉嫌掏空公司，日前已遭收押禁見，今日台北地檢署更進一步宣佈，正式依違反《證券交易法》、《商業會計法》等，就台北市的大巨蛋案，以及新北市的土城、新莊都更開發案，以涉嫌行賄與財報不實的罪名起訴趙藤雄；新北市議員周勝考、前台北市財政局長李述德也因相關案件同遭起訴。
柯文哲今日上午於文山區公所主持行動市政會議，會後接受媒體聯訪時針對此事表示困擾，如果趙藤雄因被起訴而繼續監禁下去，短期內無法出獄，「這個就麻煩了」。
柯文哲說，遠雄大巨蛋案現在已經重新進來審查了，「等於是攤牌階段」，無論要蓋、不蓋，或是能不能符合北市府的標準，都是關鍵的時間點。柯文哲說，對於遠雄的狀況，北市府也都在等待今天地檢署的結果，無法預測司法的結果，如果一起訴，就等於是會繼續收押，那遠雄裡面誰可以做決定？如果遠雄沒有人可以做決定，那這個案子怎麼繼續下去？
柯文哲表示，下午行程結束之後，會請副市長陳景峻盡速與遠雄接洽處理。
至於是否有撤換廠商的可能，柯文哲表，台灣還是一個法治的國家，而非那種獨裁國家，在目前的法律基礎上，「要動都不是那麼容易」；柯文哲更說，如果台灣是獨裁國家，早就把遠雄換掉了，但台灣是法治國家嘛。
