九孔（又稱台灣鮑魚）為台灣重要的經濟養殖物種，在歷經多年大災難後，目前整個產業已經逐漸復甦，欣喜之餘卻也存在重大隱憂，值得重視並加以防範。
台灣九孔養殖的大起大落
台灣早在1960年代就已開始進行九孔的人工育苗和養殖，並在1989年代獨創陸上高密度的立體多層式養殖，一舉量產將九孔養殖產業化；1990年代末期曾創造年產量2500公噸與單位面積產量均為世界養殖第一、產值達20億新台幣的輝煌紀錄。但2001年爆發九孔幼苗由附著基脫落死亡，後來甚至連九孔成貝也在秋冬採收期集體暴斃。雖然2003年漁業署及相關學術單位曾組成專案調查小組，分別從水質環境、微藻相、細菌相、病原菌與病毒感染等方面展開調查研究，試圖找出原因並研擬對策，卻都束手無策，延宕疫情的控制任其蔓延擴大，以致2009年產業幾乎全軍覆沒。
產官學研界一度認為，這是受到致命病毒感染，加上全球暖化、藻相改變等所致，呼籲九孔業者改養外來種鮑魚、海膽、海參等，甚至建議政府全面禁養九孔二至三年以為因應，然效果有限。台灣九孔彷彿又步入台灣草蝦養殖的覆轍和翻版。
為了復甦奄奄一息的九孔產業，2010年代台灣業者首先、然後學界和官方跟進，不約而同效法中國拯救九孔產業的成功案例，即將分布於高緯度和低緯度不同地理區的九孔進行種內雜交，並引進日本在地九孔品種，著手篩選優良的野生個體與養殖個體，再以系統雜交方法培育新品系九孔，不但可耐低溫，且能提高存活率。自此國內九孔養殖產量才逐漸回穩，從谷底的10多公噸回升到2014年的200公噸。
雜交遺傳的同時，不可放棄純種保育
值得警惕的是，由於「台日通婚」的九孔子代在台灣一年就可性成熟，其雜交融合的速度異常迅速，若不儘快採取因應措施，台灣九孔勢難保持純種。目前台灣養殖戶放養的九孔基因已經混雜到不可考；台灣其他地區的九孔地方族群（品系、品種）也很可能永遠消失，這將是不可逆與永遠無法彌補的缺憾。
引進外來九孔品系與本土九孔品系進行種內雜交，在考慮經濟價值的同時，也要分析引進九孔外來種的生物學特徵；透過種質鑑定，瞭解這些外來種與在地原生種族群的遺傳結構與差異；有必要將外來種進行隔離封閉式養殖，避免與本地種輕易發生隨機交配，以防止產生無意識的遺傳漸滲（introgression）。台日混血九孔固然有耐低溫與提高存活率的雜種優勢，但也會產生遠交衰退（outbreeding depression），導致後代對台灣環境產生適應性降低的危機，例如台日混血九孔成長比台灣原生種緩慢。遠交衰退在其他生物尚有引發侏儒症，低生育能力等各種有害影響的例子。補救方法之一，是建立官方的台灣九孔良種繁殖場或基因庫，作為保種與長期培育適應台灣各種自然條件新品種的基礎。
台灣有農業和畜產改良場，唯獨缺少水產生物的專責育種改良場。九孔是台灣重要的養殖產業，而良種決定一個產業的競爭力，台灣應按部就班，防範遺傳漸滲造成本土九孔原生地方種的遺傳特色與多樣性的喪失，育出品系，自繁、雜交、級進，建立九孔鮑魚種業三級體系（育、培、繁），落實種鮑培育專業化、良種化，加強規範管理，淘汰尾苗、劣苗，才能讓新的九孔品種維持旺盛的生命力，以免再度陷入大滅絕的輪迴。由過去水產生物引種的經驗，以雜交為主要手段的遺傳改良，一不留意往往也會伴隨破壞生物的多樣性，造成遺傳污染、品種混雜和物種滅絕，不可不慎！
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