美國貿易代表署（USTR）3月31日公布將提交美國總統歐巴馬及國會的2016年各國貿易障礙評估報告，其中在報告內容中，再度點名台灣對美國牛肉、豬肉產品的限制進口議題，並呼籲台灣基於科學證據開放美國牛肉產品，並訂定豬肉含萊克多巴胺及農藥殘留的容許量標準。
報告也對台灣對有機規範過嚴抱怨，認為未將無法排除的非故意環境污染考慮在內，已影響美有機產品銷台。
不過對此經濟部強調，因美方關切議題都與台美「貿易暨投資架構協定(TIFA)」中相關議題，因此將在TIFA架構協商等各種管道，與美方充分溝通，藉以妥善處理雙方關切議題，深化台美經貿關係，不過目前雙方尚未討論開會時間。
在這份2016年貿易障礙報告當中，美方重申關切台禁止含萊克多巴胺（Ractopamine，瘦肉精）美豬及牛雜進口，表示台灣應儘速制定萊劑含量標準；此外對於去年立法院通過台基改食品強制標示及禁止校園提供基改食品等規定，也認為不利美產品出口。
另外在外國人投資方面，美方也表示在2015年10月TIFA會議中，美方關切臺灣投資審查程序之透明性及一致性後，我方提案修正「外國人投資條例」，修正內容包括取消投資額在100萬美元以下者之事前審核程序等，但立法院迄2015年會期結束為止，尚未通過前述修正。
對於這份貿易投資障礙報告，經濟部表示，美方關切的包括敏感的美牛、美豬問題，因為不少多屬TIFA架構下協商議題，因此未來將在TIFA架構下持續與美方協商、溝通。不過TIFA會議才在去年10月於台北舉行，下次何時開會，經濟部則表示目前雙方尚未討論。
