水產品含豐富的EPA、DHA等有助身體建康，也深受國內消費者喜愛，消費量逐年增長。儘管政府部門一再強調會加強對市售水產品安全把關，但是官方抽驗之水產品仍然出現相當比例的動物用藥殘留，讓消費者難以安心，畢竟再美味的水產品若缺乏安全保障消費者還是不會買單。
檢視這些年國內水產品發生食安問題主要原因在於：養殖、流通過程因環境因素導致微生物、毒素、藥物殘留超標；加工或食用方法不當，引起食物中毒；激素、抗生素、化學藥物濫用導致殘留量超標，對人體造成危害；使用違規藥物如二氧化硫、一氧化碳、甲醛（福馬林）、亞硫酸鹽等進行漂白、保鮮、防腐；環境惡化使得水產品在生長過程中受到嚴重污染；產業間競爭激烈，以低價品充當高價水產品；監管不力使得品質不合格的水產品流入市場販售等，須強化「事前積極管理」與「事後有效處理」的雙重因應措施，而不是只靠提高十倍檢驗數量，別忘了安全水產品是靠生產部不是檢驗出來的。
而日本為全球重要的食魚國家，尤其生魚片更是日本料理的一大特色深獲消費者喜愛，日本人吃掉全球近八成的鮪魚產量，只是近來日本食品安全也如台灣一樣頻頻出包讓消費者信心大失。為確保食的安全，重拾消費者信心，日本近畿大學漁業研究實驗室除了學術研究外，在日本的美食之都銀座商業區以及大阪購物中心Grand Front Osaka裡頭開設養殖魚類主題餐廳（就取名為近畿大學水產研究所），該餐廳內所使用的魚類食材如鮪魚、真鯛、鰤魚等，都經過該大學漁業實驗室的嚴格檢查，標榜讓顧客一整年都可以品嘗到安心放心的品嘗美味的養殖魚類，還販售由該大學創全球首例完全養殖的黑鮪魚，由於天然產黑鮪容易累積重金屬，使得養殖黑鮪大受消費者歡迎，座無虛席。近畿大學還希望將該餐廳用於教育目的，讓具藝術專業的學生可以設計菜單，營養專業的學生可以設計營養套餐，讓學生能學以致用，這種結合海洋資源保育、水產食品衛生安全、水產經營、文創等理論與實務傳授，值得提供給台灣政府及各大學在思考轉型、整併、自闢財源、提高招生人數等的重要參考。
隨著原料來源的全球化使得食物供應鏈拉長，水產品受污染的風險相對提高，尤其零售階段不易保鮮更應列為管控的重點。為了確保消費者食用安全起見，我國政府除了應努力研發高靈敏、快速篩選、偵測及萃取方法來加強對進口水產品把關外，應該參考美日作法積極建構完備的水產品品質安全管控機制包括：政府監管機制、產業自律機制、生產者自控機制、消費者訴求機制和社會監督機制，彼此相互聯動構成一個完整體系；同時輔導國內捕撈及養殖水產品取得國際衛生安全與生態標章等認證，以方便消費者選購，並整合各大專院校水產相關科系人力投入水產品安全相關研發、檢驗、查緝、廠商輔導等工作，才能真正讓消費者吃的安心。
