台南市長賴清德日前率團前往上海，參加「陳澄波百二誕辰東亞巡迴大展」，在復旦大學座談會回答姜義華教授詢問時，提到台獨與六四事件。指出民進黨不論＜台獨黨綱＞或是＜台灣前途決議文＞，都是歷史發展的軌跡。＜決議文＞的台灣的前途由2300萬人民決定，這是有社會極大的共識，。對復旦大學在六四學運時，有上百位教師站出來支持言論自由，表示肯定。
賴市長認為，雖然有人提出凍結＜台獨黨綱＞的建議，中國要理解，是先有台獨或先有民進黨？如果不能理解歷史軌跡，是無法解決問題的。意思是，即使沒有民進黨，台灣仍會有台獨主張。中國國台辦發言人范麗青隨後表示，中國主權與領土並未分裂，兩岸同屬一國。「任何涉及中國主權和領土完整的問題，必須包括台灣同胞在內的全中國人民共同決定」。引起台灣各界人士憤怒與反彈。然而民進黨是台獨黨嗎？實在值得認真檢視。
中國官方口徑一致，認為民進黨是台獨黨。聲言民進黨不廢除台獨黨綱，沒有與其接觸之可能。民進黨立法院黨團總召柯建銘就認為＜台獨黨綱＞已完成階段性任務，是民、共交流的障礙，建議凍結＜台獨黨綱＞，謝長廷也呼應台獨黨綱不能不處理。近日不少黨代表（例如許信良、陳昭南等）也同樣認為不凍結台獨黨綱，會影響執政之路，準備在即將召開的全代會提案。當然，也有不同的聲音，游錫堃就認為台灣獨立是民進黨創黨的核心價值，如果把它拿掉，民進黨與國民黨有什麼不同？游錫堃甚至與郭正亮隔空互嗆。林濁水與陳淞山還為是誰在黨綱中加入建立台灣共和國字樣，引發論戰。甚至馬英九即使出門在外，仍不甘寂寞，對民進黨指三道四，認為台獨沒有必要。連台北市長郝龍斌也摻一手，肯定凍結「台獨黨綱」是一個正確方向，認為目前台灣民眾最大的共識是中華民國，台灣獨立並非主流民意。
台灣有些學者與媒體，把獨派分為體制內獨派與體制外獨派。認為體制內的獨派認同中華民國，爭取政權，以達建國目標，其他則屬體制外獨派。所謂體制內獨派應指民進黨而言，民進黨創黨之初，派系複雜，有美麗島、新潮流、正義聯線、福利國聯線等，當時即有選舉路線與獨立路線之爭。由於解嚴後獨派聲勢看漲，民進黨通過建立台灣共和國之黨綱。但幾次選舉失利，民進黨逐漸向選舉路線傾斜，對獨派團體既利用又排擠。曾任民進黨文宣部主任，現任政大文學院長的陳芳明，即以文學筆調說：「民進黨一方面寄託於遙不可及的台獨黨綱，一方面又強烈緬懷台灣地位未定，不是活在未來，便是活在過去，放逐現在。」台灣是否是一個主權獨立國家，台灣地位是否已經改變，眾說紛紜，不是台灣單方面關起門來說了就算數，應該依照國際社會的標準加以檢驗。不能放諸四海而皆準的說法，只是自我欺騙、自我陶醉而已。
有人說，結束國民黨外來統治的本質，總統直接民選兩件事代表台灣是一個真正主權獨立的國家。但政黨輪替與國家獨立能混為一談嗎？國民黨黨國體制復辟，馬英九定位「中華民國與中華人民共和國同屬一國」，是「一國兩區」，他認為「一中各表」可以改善國際關係。當國際社會都公認中華人民共和國是中國唯一合法政府，馬英九的說法會讓國際社會接受嗎？聯合國以會員普及為原則，只要是主權獨立的國家，都有資格加入，台灣為何被拒於門外？與其埋怨打壓、矮化，不如反躬自省，解決實際問題，方是正辦。
其實這些說法都是嚴重誤解，民進黨雖然保留＜台獨黨綱＞，陳水扁執政時也喊出「台灣中國、一邊一國」，但民進黨早於1999年就已另訂優先適用的＜台灣前途決議文＞，取代＜台獨黨綱＞。將黨綱之未來進行式的建立台灣共和國主張，改為過去完成式的台灣已是主權獨立的國家、依現憲法國號是中華民國。既然台灣已經獨立，就不必再從事獨立運動。因此認為民進黨是台獨黨，顯然與事實不符。＜決議文＞稱任何改變現狀，必須經過臺灣2300萬人同意，只能視民進黨為維持事實獨立現狀的黨。但民進黨認同被國際社會除名的中華民國，讓台灣戴上中華民國假面具，國際社會就不可能承認台灣是一個主權獨立國家。
這是民進黨為選票考量，向現實妥協，轉型走中間路線的結果，當時有「台獨是票房毒藥」、「台獨是台毒」的說法。果然，2000年政黨輪替陳水扁在就職演說中，就提出「四不一沒有」，「只要中共無意對台動武，本人保證在任期之內，不會宣布獨立，不會更改國號，不會推動兩國論入憲，不會推動改變現狀的統獨公投，也沒有廢除國統綱領與國統會的問題。」民進黨為了安撫一些不認同中華民國的人，而有「正名、制憲」的動作。但明知體制內修憲、公投門檻過高，民進黨在國會席次未過半的情況下，只得草草了事、無疾而終。
陳水扁卸任前，2008年5月陸委會出版《堅持「主權、民主、和平、對等」四原則的兩岸關係》一書，收錄蔡英文、吳釗燮、陳明通三任主委的大陸政策重要文件。談到台灣與中華民國到底是怎樣的一個關係時，認為陳水扁在經過多年的執政後，試圖從歷史發展的角度提供這項問題的答案，那就是：從1912年至1949年是「中華民國在大陸」，1949年到1988年蔣經國去逝前是「中華民國到台灣」，李登輝時代是「中華民國在台灣」，2000年政黨輪替後是「中華民國就是台灣、台灣就是中華民國」。進入體制內的民進黨，依違於台灣與中華民國之間，冀望兩邊得利，尋求社會共識，顯然欠缺說服力。國際社會對台灣與中華民國劃分得十分清楚，不可能接受這種說法，無助於台灣國際地位的提升。這也是陳水扁作為「中華民國總統」，欲以「台灣」名義申請加入聯合國，被打回票的主要原因。
蔡英文在2012年大選仍延續「台灣是中華民國、中華民國是台灣」的說法，謝長廷且說「中華民國憲法代表台灣」，認為這是台灣主流民意，但並未獲得黨內共識，游錫堃推動＜正常國家決議文＞也未獲得通過。現在的民進黨只注重民生議題，與國民黨爭奪政權，不願碰觸國家定位問題。台獨黨綱在民進黨猶如雞肋，食之無味，棄之可惜。在蔡英文大選失利後，內部檢討的結論認為是忽略中國因素所致，一度傳出應向國民黨靠攏的聲音，謝長廷甚至認為「如果國、共聯手對付民進黨成為常態，民進黨的重新執政，會變成一個傳說。」因此主張放低姿態，與中國擴大交流。由於民進黨認為＜台獨黨綱＞已被＜台灣前途決議文＞所取代，有無＜台獨黨綱＞已無足輕重。民進黨擁抱中華民國不遺餘力，愛護車輪牌「國旗」，比國民黨更加熱烈，說民進黨是台獨黨，實在是無法承受之重。
陳儀深教授在《從建黨到執政－民進黨相關人物訪問紀錄》導言＜轉捩點之發生＞中提到「有研究者認為1986至1991年乃是民進黨『台獨論述正式制度化為集體目標的強化期』；只不過1991年年底民進黨遭逢二屆國代選舉失利，其台獨論述乃退回『現狀描述』的務實（或模糊）期。」末後又提到「今日民進黨為了處理中國政策，為了必須與北京政府來往（交手），是否應以『憲法共識』作為最好的論述是一回事，宜不宜把當年權變順應的『回歸中華民國憲法』當作創黨精神，從歷史的角度而言是另一回事。」秉承黨外時期以來「民主、自決、救台灣」之民族民主主義精神的民進黨，如何作一個負責任的政黨，今後將何去何從？這是亟待該黨人士與全體台灣人民嚴正思考和面對的課題。
