當國際常設仲裁法院依據《聯合國海洋法公約》明確裁決太平島是「礁」不是「島」，日本，擔心了。日本有一派看法開始表達憂慮，認為圍繞南海的外交戰將要開啟第二幕，對於日本而言，接著的挑戰，是沖之鳥「島」有關的海洋權益可能受到影響。
影響的，是涉及了日本周圍40萬平方公里的經濟海域。
一開始，日本對這次的南海仲裁結果喜形於色，認為中國在南海主權議題上完敗，這將是進一步壓迫、收緊對中國包圍網的良機。外務省官員甚至第一時間就對裁決表示歡迎。
可是，才高興沒多久，來自《共同社》就引述外務省人士的看法，認為此次裁決「可能會影響到日本的海洋權益」。畢竟，南海的南沙群島不存在產生專屬經濟區（EEZ）的「島」的判定可能誘發一種爭論，即日本作為EEZ基點的東京都沖之鳥「究竟是島還是岩礁？」現在把南沙群島判成「岩礁」，中國或許會藉這樣的機會，進一步採取動搖日本的措施，「這是令人頭痛的問題」。
位於日本最南端的無人島（礁）沖之鳥周圍約有10公里珊瑚礁。由於海浪侵蝕，漲潮時沖之鳥島的面積據稱僅有約4平方米。其周圍的EEZ約有40萬平方公里，超過日本國土面積，若被認定為「岩礁」，對日本的打擊之大不可估量。
《共同社》訪問了海洋政策專家、東海大學教授山田吉彥指出，根據這種仲裁結果，沖之鳥會被視為「岩礁」的，山田教授說，日本政府必須對這樣的島嶼的管理及權利主張方法加以檢證。
