台灣NGO組織工作者李明哲，因在網路推動民主改革，遭中國以「巔覆國家政權」罪名判刑5年，這是北京企圖強力掌控台灣的一面縮影。另一方面，繼黑道之後，台灣宗教界遭中共滲透收買隱憂，亦逐漸浮上檯面；光以基督教為例，就有中國教會跨海而來，頻頻與台灣教會團體接觸。
今年11月間，位於美國的「全球台灣研究所」（Global Taiwan Institute, GTI）舉辦一場宗教與台灣民主化的座談會，台灣玉山神學院助理教授陳文珊（Chen Wenshan）表示，中共當局對於教會控制引發的寒蟬效應，影響香港，現在更蔓延至台灣，有教會人士為了到中國傳教開始自我約束，避開（政治）敏感話題。
陳文珊向《美國之音》（VOA）表示，我認識不少香港神學院教授，他們也慢慢開始不太願意碰觸敏感議題，有意識選擇噤聲，這個情形甚至（已經）影響到台灣。我們發現為數可觀的不同台灣宗教組織，它們能夠舉辦大型活動，錢從哪裡來？所以台灣最近也在開始尋思，如何通過宗教團體法，（目的之一）就是去查這些宗教團體的資金來源與流向，因為我們擔心（中共操控）香港事情，會複製到台灣。
她還說，中國沒有真正的宗教自由，中共只是利用宗教來控制人民，其監控教會的手法如當年的國民黨一樣。她說：「以往國民黨在台灣戒嚴時期，其宗教審查制度就是派一個人或一個黨工，在下面聽你講道或檢查你的出版刊物。」
曾於1960-1970年代擔任天主教教士在台灣傳教的民進黨駐美代表處主任彭光理（Michael J. Fonte）在GTI舉辦的座談會表示，基督教在台灣有許多派別，國民黨執政者蔣介石和他的妻子宋美齡也是基督徒，但他們是掌權者，要求威權統治下的「好基督徒」，不應涉入政治。然而，台灣基督長老教會因為日本殖民統治之前，就紮根南台灣。他們透過台語傳教、出版教會刊物，其「本土化與教育性」堅持，成了戒嚴時期，台灣本土政治菁英在追求社會正義、人權、自由的重要精神支柱；也為台灣民主化過程，發揮重大催生作用。
陳文珊也向《美國之音》表示，台灣年輕一代很愛台灣，常想「為何（中國）要打壓我們？」他們不喜歡泛藍立場，因為不想被統一，（不願）如香港一樣遭中國欺凌，這一代青年人以台灣的民主為榮。
