南方澳跨港大橋斷橋、坍塌事件發生三天，經救災單位全力救災、搶通漁港後，外界也開始追究起事故責任，何以橋齡僅約廿年左右的跨港大橋會突然斷裂崩塌？究責矛頭直指負責維運的主管機關臺灣港務股份有限公司。3日稍早，交通部長林佳龍證實臺灣港務公司董事長吳宗榮已口頭向他請辭，林佳龍說：「我也同意了。」上午赴立法院交通委員會備詢的吳宗榮董事長，則在會後受訪時表示交通部會有懲處，他不方便多談。另一方面，行政院發言人Kolas Yotaka則針對此事強調，政府會負起責任不推諉，並持續追究人為疏失。
港務公司被踢爆廿年來從未對南方澳跨港大橋自主檢測，林佳龍在立院時也坦承疏失，外界視吳宗榮的去職為政府止血的第一步。土木工程出身的吳宗榮長期任職高雄與臺南市政府，轉任港務公司董事長僅一年，先前擔任臺南市副市長。
